El Centro de Altos Estudios Amazónicos (CAEA) viene a ser el resultado de un convenio del Centro de Estudios Teológicos de la Amazonía (CETA) con la Pontificia Universidad Católica del Perú (PUCP).  

El CETA es un organismo autónomo dependiente del Vicariato Apostólico de Iquitos, bajo la condición jurídica de Asociación Civil sin fines de lucro, con treinta y seis años al servicio de la reflexión religiosa y cultural de la Amazonía y una presencia gravitante en el desarrollo cultural de Iquitos. La Pontificia Universidad Católica del Perú, fundada hace más de 90 años, goza de merecido reconocimiento en los estándares de los centros de estudios superiores en América Latina y el mundo.

La selva amazónica constituye un gran retazo de la desvertebración del conjunto no solamente nacional, sino de los países de la Organización del Tratado de Cooperación Amazónica (OTC). En el Perú, este espacio de bosques interminables, que otro tiempo recorrieron en canoa los misioneros, con innumerables ríos, dos terceras partes del territorio nacional, casi tres millones de habitantes, que constituyen parte del mosaico demográfico de 60 etnias, además del movimiento de una desbordante urbanización, se ha convertido en sucesivas luchas en una expresión cada vez más angustiosa. Los conflictos de los pueblos indígenas con las empresas de extracción petrolera y maderera sostenidos a lo largo de lo que va de este año son una muestra.

Frente a estas vertiginosas condiciones las instituciones académicas superiores carecen de profesionales que tengan en cuenta al hombre más allá de su dimensión biofísica y económica. No poseen carreras que tengan en cuenta otras dimensiones del hombre y la sociedad: filosofía, antropología, sociología, psicología, historia, geografía, arquitectura o similares están ausentes de su comprensión y no dan una respuesta integral adecuada a los retos que supone abordar una realidad tan amplia y difícil como la de este universo, cuyas aguas tendrán un futuro trascendental en el cambio climático del futuro.

La voluntad del proyecto de Postgrado en Altos Estudios Amazónicos, aprobado por la Universidad Católica, no es suplir carencias, sino complementar lo existente, abriendo nuevos rumbos al pensamiento amazónico y ofreciendo generosamente una apertura a las demás instituciones científicas, académicas o de desarrollo. Dicho Postgrado entrará en funcionamiento a mediados del año académico 2009.

            Con esta nueva iniciativa, la Iglesia estará representada en una nueva dimensión del anuncio misionero: su relación con la comunidad científica y su aporte al desarrollo regional y la superación de la pobreza.